هيمن الخلاف على صلاحيات سلطة الاتحاد الأفريقي وتوزيع حقائب الأمانات الجديدة على جلسة اليوم الثاني للمجلس التنفيذي للاتحاد. فالمعترضون على منح صلاحيات واسعة لسلطة الاتحاد يتخوفون من تأثير ذلك على السيادة الوطنية لكل بلد.