تناول تقرير منظمة العفو الدولية الانتهاكات المنظمة التي تقوم بها السلطات المصرية ضد حقوق الإنسان بدعوى الحفاظ على الأمن. وحذر التقرير من أن تكون التعديلات الدستورية الجديدة وخاصة المادة 179 الخاصة بقانون مكافحة الإرهاب، مقدمة للمزيد من الانتهاكات. كما عبرت المنظمة عن قلقها من المحاكمات العسكرية الخاصة بقيادات الإخوان.